批二层造三层属违建，将面临罚款或刑事责任。依据《土地管理法》等，未批先建或超建均违法，严重者可能影响房屋合法性及使用权，甚至导致房屋被拆除。
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常见处理方式为缴纳罚款、补办手续或拆除超建部分。选择时，若超建部分可补办手续且罚款可承受，则补办并缴费；若无法补办或罚款过高，需考虑拆除。
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违建需处理。具体操作：1.若能补办手续，尽快向村委会、村政府申请；2.缴纳因超建产生的罚款；3.若无法补办或罚款过高，需拆除超建部分，恢复合规状态。