已签解除协议，离职申请写个人原因不影响。但需确保两者不冲突，依据《劳动合同法》，不一致可能导致纠纷，影响权益保护。
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离职申请与协议不符，处理如下：1.核对协议与个人原因是否冲突，无冲突则正常离职；2.如有冲突，与公司HR沟通，协商修改离职申请或协议；3.协商无果，保留证据，向劳动仲裁机构申请调解或仲裁。
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处理方式有协商、履行原协议或咨询劳动仲裁。若离职原因与协议一致，按协议执行；有出入则与公司协商，协商不成可申请劳动仲裁。